支原体肺炎的控制以疫苗与药物结合应用为最好，这是有资料证明的。从抗体水平、饲料报酬、生长速度、经济效益各方面比较均优于单用疫苗和单用药物。

单用疫苗和单用药物比，各具其优缺点。

疫苗具有产生抗体水平高，保护时间长的优点，但其免疫保护率不高，只针对支原体的某一株或几株，对其它细菌无效。

药物可弥补疫苗的不足。对猪肺炎支原体有效的药物如泰妙菌素（支原净）、强力霉素等在预期发病前3-4周通过饲料投喂7-14天，可有效控制支原体肺炎及其继发或混合感染的发生。“脉冲式给药”即间歇性集中短时间大剂量给药，是一种有效的给药方法。可用药1-2周，停2周，如此反复进行。这样可让猪对有关病原体有一定程度的接触，不至于发病，而且能够产生一定的免疫力。